真正要建造一座水上木屋和在陆地上搭建木屋是有很大差别的。在水上搭建木屋一般有两种方式，一种是将木桩或者是钢架打入湖底，然后再在湖面上架出一个平稳的平台，在此平台上再搭建小木屋；还有一种是模拟小舟，就是在水面上搭建一个可随水波浮动的台面，再在上面建起小木屋。
这两种方式各有千秋。直接将基础打入湖底的水上小木屋优点也是多多的，像是这样子的小木屋虽然是架在水面之上，但他在享受水面带来的清凉的同时又不会受到太多水面晃动的影响，这就是说，即使湖面是波涛汹涌的，这座水上小木屋却依然是稳稳当当的。
另一个方式的水上小木屋是用浮桶的浮力将木屋架于水面之上。这样子的小木屋就如同是水面上的小船，会随着水波上下浮动。在设计建造时，我们会预先计算好这浮桶的承载力，让我们的木屋即使遇到一定等级的风浪水波也可以安然无恙。
